如果安装了FTP服务器会询问是否添加FTP账号
如果需要添加输入 y ，不添加输入 n 回车。
提示Enter ftp account name: 后输入要创建的FTP账号名称，回车确认。
提示Enter password for ftp account FTP账号: 后输入要设置的密码，回车确认。
接下来是1.4新增的添加SSL功能
如果需要添加输入 y ，不添加输入 n 回车。
选择了添加SSL会提示
有两个选项，
1 选项为使用自己准备好的SSL证书和key。
提示Please enter full path to SSL Certificate file 后输入要SSL证书的完整路径和文件名，回车确认。
提示Please enter full path to SSL Certificate Key file: 后输入输入要key文件的完整路径和文件名，回车确认。
2 选项为使用免费SSL证书提供商Letsencrypt的证书，自动生成SSL证书等信息。
需要输入一个邮箱回车确认。
提示 Press any key to start create virtul host... 后，回车确认便会开始创建虚拟主机。
添加成功会提示添加的域名、目录、伪静态、日志、数据库、FTP等相关信息，如下图：
伪静态管理
LNMPA或LAMP可以直接使用网站根目录下放.htaccess 来设置伪静态规则(具体规则可以去程序官网网站找google百度)，但是在LNMP下，需要使用Nginx伪静态规则。
伪静态可以随时添加或删除，如果添加完虚拟主机后忘记或没有添加伪静态，可以通过修改配置文件来添加伪静态。
虚拟主机配置文件在：/usr/local/nginx/conf/vhost/域名.conf
伪静态规则文件需要放在/usr/local/nginx/conf/ 下面。
编辑虚拟主机配置文件，可以使用vi、nano或winscp，后2个工具对新手来说简单些。
例如前面我们添加的虚拟主机，打开后前半部分配置会显示如下：
在root /home/wwwroot/www.vpser.net;这一行下面添加：
include wordpress.conf;
上面的wordpress.conf为伪静态文件，如需要其他伪静态文件自己创建个并上传到/usr/local/nginx/conf/ 下面并include 伪静态.conf; 加完保存，执行：/etc/init.d/nginx restart 重启生效，如果报错可能是添加有误或伪静态规则有误。
1.4及之前版本伪静态文件都在 /usr/local/nginx/conf/ 目录下
1.5及之后版本伪静态文件都在 /usr/local/nginx/conf/rewrite 目录下
伪静态文件名称后面带2的是二级目录的伪静态，可以根据自己需求修改里面二级目录的名称或复制为其他名字后include到虚拟主机配置文件中。
上传网站程序
如果已经安装FTP服务器可以直接使用ftp客户端通过你的FTP信息登录后上传网站或sftp等软件上传网站，设置好相关权限开始安装即可。
上传网站后建议执行：chown www:www -R /path/to/dir 对网站目录进行权限设置，/path/to/dir替换为你网站目录。
为了安全可以将一些不需要PHP运行的上传文件之类的目录去掉执行权限，参考：http://www.vpser.net/security/lnmp-remove-nginx-php-execute.html
已存在虚拟主机添加ssl证书开启https
对于已存在的虚拟主机添加https站点，可以执行：lnmp ssl add 命令添加ssl证书，目前有两种方式一种是使用自备的ssl证书，二是采用Let'sEncrypt的免费证书。添加过程和前面的添加虚拟主机的过程是一样的，只是会多一项填写ssl证书和key的步骤或直接选择Let'sEncrypt自动生成证书。
如果是1.*版本升级到1.4或更改版本的需要参考：https://lnmp.org/faq/upgrade1-4.html 中的说明，如果有提示不安全或不显示小绿锁上面链接中也有说明。
列出网站(虚拟主机)
执行：lnmp vhost list
删除网站(虚拟主机)
执行：lnmp vhost del
删除网站会先列出当前已有虚拟主机，按提示输入要删除的虚拟主机域名 回车确认。
这里只是删除虚拟主机配置文件，网站文件并不会删除需要自己删除。
LNMP 1.2下需要执行：chattr -i /网站目录/.user.ini 后才能删除网站目录。
当执行chown或chmod对网站目录属主属组或权限进行操作时可能会提示chown: changing ownership of `/home/wwwroot/default/.user.ini': Operation not permitted，不需要理会，如果有强迫症可以参考前面先进行chattr -i的操作。
默认网站(虚拟主机)
LNMP默认网站配置文件：/usr/local/nginx/conf/nginx.conf
LNMPA默认网站配置文件：/usr/local/nginx/conf/nginx.conf 和 /usr/local/apache/conf/extra/httpd-vhosts.conf
LAMP默认网站配置文件：/usr/local/apache/conf/extra/httpd-vhosts.conf
防跨目录设置
LNMP 1.1及之前的版本使用php.ini里面，open_basedir设置
LNMP 1.2及更高版本防跨目录功能使用.user.ini，该文件在网站根目录下，可以修改.user.ini 里面的open_basedir的值来设置限制访问的目录或删除来移除防跨目录的设置。
.user.ini文件无法直接修改，如要修或删除需要先执行：chattr -i /网站目录/.user.ini
可以使用winscp文件管理、vim编辑器或nano编辑器进行修改。
删除的话rm -f /网站目录/.user.ini 就可以。
修改完成后再执行：chattr +i /网站目录/.user.ini
.user.ini不需要重启一般5分钟左右生效，也可以重启一下php-fpm立即生效。
如果要更改网站目录必须要按上述方法修改防跨目录的设置，否则肯定报错！！
LNMP 1.4上如果不想用防跨目录或者修改.user.ini的防跨目录的目录还需要将 /usr/local/nginx/conf/fastcgi.conf 里面的fastcgi_param PHP_ADMIN_VALUE "open_basedir=$document_root/:/tmp/:/proc/"; 在该行行前添加 # 或删除改行，需要重启nginx。
LNMP 1.4上也可以直接使用lnmp1.4/tools/ 目录下的 ./remove_open_basedir_restriction.sh 进行移除。
在Thinkphp、codeigniter、Laravel等框架下，网站目录一般是在public下，但是public下的程序要跨目录调用public上级目录下的文件，因为LNMP默认是不允许跨目录访问的，所以都是必须要将防跨目录访问的设置去掉，有时候这些框架类的程序提示500错误也可能是这个问题引起的。
LNMPA或LAMP 模式1.2版本以上的防跨目录的设置使用的对应apache虚拟主机配置文件（lnmp管理工具添加的话文件是 /usr/local/apache/conf/vhost/域名.conf ）里的php_admin_value open_basedir参数进行设置。如果不需要设置可以在前面加 # 进行注释，或自行修改目录的限制。
重启apache生效。
pathinfo设置
LNMP上各个版本pathinfo各个版本的设置基本一样：
lnmp v1.1上，修改对应虚拟主机的配置文件(/usr/local/nginx/conf/vhost/域名.conf)
去掉#include pathinfo.conf前面的#，把try_files $uri =404; 前面加上# 注释掉。
1.2,1.3上，修改对应虚拟主机的配置文件(/usr/local/nginx/conf/vhost/域名.conf)
将include enable-php.conf;替换为include enable-php-pathinfo.conf;
修改pathinfo需要重启nginx生效。
数据库管理
1.3以上版本，可以在添加虚拟主机时选择创建数据库，也可以单独使用 lnmp database add 按提示添加数据库，添加的用户名和数据库名是同名的。
添加数据库命令：lnmp database add
编辑数据库用户密码命令：lnmp database edit
删除数据库命令：lnmp database del
列出所有数据库命令：lnmp database list